El Área Académica constituye el núcleo de las actividades académicas de la Universidad, es un espacio de integración de las actividades derivadas de las funciones sustantivas donde se integran las unidades académicas y los programas académicos de docencia en los tipos educativos medio superior y superior en sus distintos niveles así como los de investigación y extensión de la cultura y los servicios, propuestos por el Consejo Coordinador Académico y aprobados por el Consejo General Universitario.

• Nivel medio superior (preparatorias)
• Programas académicos de nivel superior (licenciatura)

La Universidad Autónoma de Nayarit ofrece 26 programas académicos distribuídos en 5 áreas.

• Ciencias Básicas e Ingenierías.
• Ciencias Biológico Agropecuarias y Pesqueras.
• Ciencias de la Salud.
• Ciencias Económicas y Administrativas.
• Ciencias Sociales y Humanidades.
• Unidade académicas de nivel superior.